מפגש מורכב בין נינטנדו לאטלוס ליצירת Tokyo Mirage Sessions #FE, שהוביל להתפתחות בעייתית אך גם מעניינת. מפיק Atlus Shinjiro Takada ומפיק נינטנדו Hitoshi Yamagami שיתפו את החזונות שלהם בראיון, והתחקו אחר התפתחות הפרויקט, שנולד כהצלבה בין Shin Megami Tensei ל-Fire Emblem.
בשלב ראשוני נראה היה שקשה ליישב בין שתי הזכייניות: הרעיון בצד של אטלוס היה ליצור משחק תפקידים שונה מהרגיל, אך מבוסס על מכניקה מוצקה, בעוד שהצד של נינטנדו בחן ניואנסים של משחקי הדמיית אסטרטגיה. , אופייני לסדרת Fire Emblem, אך לא מוצא את ההתאמה הדרושה, שישה חודשים לאחר תחילת הפיתוח שונה הכיוון לחלוטין, תוך שהוא מחבק את המאפיינים המייצגים בצורה הטובה ביותר משחק תפקידים של Atlus. בהתחשב בתוצאה, התברר שהשביל המפותל הוא הנכון.
